Notes

NIEMIECKI MP3 - Kursy I Nauki Do Szkoły Niemieckiego MP3
Genetic variants regulate expression of SMIM1 and the Vel blood group antigen. Extensive genotyping of blood groups Duffy Kidd and AB0 by next generation sequencing. Obok często stosowanych protokołów typu home-made, opartych na idealnych metodach biologii molekularnej, i zaawansowanych metod i testów ze znakiem dyrektywy dla wyrobów medycznych do diagnostyki in-vitro (IVD, in vitro diagnostic device directive) do typowania antygenów grup krwi, jest szybka implementacja najnowszej technologii sekwencjonowania następnej generacji (NGS, next generation sequencing) do badań polimorfizmów, które posiadają podłoże swoistości antygenowych. 1. Avent N.D., Madgett TE., Halawani A.J., Altayar M.A., Kiernan M., Reynolds TJ. Next generation sequencing: academic overkill or high-resolution blood group genotyping? 2. wypracowanie , Halawani A.J., Kiernan M. i wsp. 10. van der Schoot C.E., Ait Soussan A., Beckers E. i wsp. 12. Belsito A., Costa D., Fiorito C. De lorio G., Grimaldi V, Napoli C. Erytrocyte genotyping with HEA Bead Chip Kit: our experience at Azienda Ospedaliera Universitaria, Second university of Naples. W zestawieniu badacze podkreślili, że rozbieżności wyników genotypowania allelu JK otrzymane techniką HEA BeadChip i fenotypowania antygenów Jka i Jkb są bardzo oryginalne (7/60 000), co świadczy wysokiej wiarygodności stosowania metod molekularnych w determinacji antygenów spośród ostatniego układu.

Badacze wykryli siedem różnicy między genotypem i przewidywanym fenotypem a oznaczeniami serologicznymi - dwa pod względem określenia obecności antygenu Jka i pięć dotyczących antygenu Jkb. 02.988A.1095C o obniżonej ekspresji antygenu Jkb. A weak kodującego warianty antygenu Jk(a) o osłabionej ekspresji. W sesji plakatowej także zaprezentowano szereg doniesień o wykryciu nowych alleli kodujących warianty prezentujące się osłabionym fenotypem lub nieulegające ekspresji, które znaleziono metodami analizy DNA. Metodami serologicznymi takie rodzaje są określane jako Jk(a-). Wyniki oznaczenia antygenów RhC, E i Kell obiema metodami wykazały jeden wynik rozbieżny w wersji dawców i aż 27/50 w całości pacjentów. Podsumowując, można dostrzec jak wielkie zainteresowanie metodami genotypowania antygenów krwinki czerwonej i żyjąca dostępność platform i technologii do badań o wysokiej przepustowości przekłada się na rozwój informacji na fakt bogactwa podłoża molekularnego różnych swoistości antygenowych. Na XXXIII światowym zjeździe w Seulu, w Korei Południowej, zastosowanie technologii analizy kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA, deoxyribonucleic acid) w badaniach antygenów krwinek morzach i płytkowych omawiano na sesjach „Genotypowanie Grup Krwi” (Blood Group Genotyping), „Białka Błonowe Krwinki Czerwonej” (Red Cell Membrane Proteins), „Genotypowanie grup krwi: nowy partner w laboratorium” (Blood genotyping: a new ally in your lab) i na sesji satelitarnej zorganizowanej przez firmę Grifols.

Obecnie analiza DNA do badań antygenów krwinek skupia się przede wszystkim na typowaniu wielokrotnych dawców krwi w planie wynajdywania postaci z rzadkimi antygenami lub genotypami wychodzącymi z małą częstością, ale więcej w jeszcze znaczniejszym stopniu badania stoją się średnie w odniesieniu do pacjentów wymagających wielokrotnych transfuzji. Dodatkowo przeprowadzone badania całych sekwencji genów dostarczają informacji o byciu wzorów mutacji polimorficznych w nowych regionach alleli kodujących antygeny grup krwi, i znaczenie wykrywanych sprzężeń w odniesieniu do działań immunologicznych zatrzymuje się nowym wyzwaniem dla badaczy. Zaznaczył, że przy wyborze szkoły i zakresu genotypowania należy obracać się lokalnymi sprawami i uwarunkowaniami oraz opracować plan genotypowania dawców w nawiązaniu do dyspozycji finansowych danego ośrodka, szczególnie przy poszukiwaniu cech rzadkich, gdy pytania dotyczą dużych liczebnie grup. Gdy już jesteś w zakręcie, w pochyleniu, zapomnij o zwalnianiu czy - o zgrozo! Różnica między tymi dyscyplinami wykazuje się wtedy, gdy prosimy o powody akceptacji bądź odrzucenia danej koncepcji.


Badacze podkreślili dużą częstość występowania różnice między technikami genotypowania a fenotypowania i potrzebę opracowania algorytmu włączenia badań genotypu antygenu Fya/Fyb jako koniecznego uzupełnienia oznaczeń serologicznych. Na wykonanie prelegent podkreślił, że z jakiejś strony obecnie stosowane są w cali skomputeryzowane platformy do genotypowania grup krwi o wielkiej przepustowości, z pozostałej zaś uzupełnianie podstaw danych wciąż podejmuje się ręcznie przez operatora, gdyż brakuje rozwiązań umożliwiających przepływ danej między wykorzystywanymi platformami oraz systemami szpitalnymi czy laboratoryjnymi. Po przesłaniu odpowiedzi zostaną wystawione oceny (lub nie, bo nie wszyscy odzywają się do mnie). Novel alleles at the Kell blood group locus that lead to Kell variant phenotype. Duffy blood group typing: is genotyping more accurate than phenotype for Duffy Blood grouping? Pełne zsekwencjonowanie alleli kodujących antygeny z planu Duffy wykazało obecność dwóch kolejnych miejsc polimorficznych w eksonie drugim (obok kodujących antygen Fya i Fyb) i czterech we fragmentach intronowych genu. Badacze opracowali kolejne kroki sekwencjonowania antygenów z zespołów Rh, Duffy i Kidd: przygotowanie biblioteki przez amplifikację całkowitej sekwencji genomowej alleli kodujących swoistości antygenowe z zastosowaniem reakcji łańcuchowej polimerazy o wielkim wpływie (long-range PCR, long-rangepolymerase chain reaction), ich fragmentację i ligację z oligonukleotydami adaptorowymi, zawierającymi sekwencje kodu z identyfikatorem, aż po sekwencjonowanie mieszaniny 70 próbek na raz.


Homepage: https://sprawdzianiks.pl/artykul/20134/przemys-wysokiej-technologii-w-polsce-firmy