Notes

fASE Immediate early
Kromosom λ masuk, terjadi transkripsi oleh RNA polymerase sel inang.
Inisiasi transkripsi dimulai dari :
- PR (Transkripsi ke kanan) → gen Cro
Cro memiliki fungsi ganda: mencegah sintesis respressor (tindakan diperlukan untuk melanjutkan siklus litik) dan mematikan ekspresi gen immediate early (yang tidak diperlukan dalam siklus litik).

- PL (Transkripsi ke kiri) → gen N (antiterminator)
Kode N untuk faktor antiterminasi yang memungkinkan proses transkripsi dilanjutkan ke gen delayed early.

Delayed early
en delayed early meliputi:
1. dua gen replikasi (diperlukan untuk infeksi litik).
2. tujuh gen rekombinasi (beberapa yang terlibat dalam rekombinasi selama infeksi litik).
3. diperlukan dua DNA λ untuk mengintegrasikan inti kromosom bakteri untuk siklus lisogenik.
4. tiga regulator. Regulator memiliki fungsi berlawanan:
- Pasangan CII-CIII dari regulator yang dibutuhkan untuk memulai sintesis repressor.
- gen Q regulator merupakan faktor antiterminasi yang memungkinkan RNA polimerase inang untuk melanjutkan ke gen late.
RNA polymerase pada sel inang 1. Kanan : PR → cII, O, P, Q 2. Kiri : PL → cIII
Menstimulasi transkripsi gen-gen delayed-early :
- mengekspresikan gen cII dan cIII (relevan untuk siklus lisogenik)
- gen O dan gen P (untuk replikasi kromosom λ)
- gen Q (untuk transisi dari delayed-early ke late)
Transisi litik ke liso
Gen Q (antiterminator) ada atau tinggi → terjadi siklus lisis.
Gen Q (antiterminator) tidak ada atau rendah → mencegah ekspresi gen-gen dan fase late → tidak terjadi siklus lisis tetapi masuk ke siklus lisogenik.

Fase late
Dimulai saat protein Q menstimulasi transkripsi gen-gen late seperti gen penyandi kepala, ekor dan faktor-faktor litik.
Gen late yang mengandung gen lisis S-R dari ujung kanan dari DNA linear, serta kepala dan ekor dibentuk oleh gen A-J dari ujung kiri.
Akhirnya terbentuklah bagian kepala dan ekor virus secara sempurna.
Setelah itu membran dinding sel inang pecah, virus-virus baru yang terbentuk di dalam sel inang akan keluar dan siap untuk menginfeksi sel inang yang baru.

SIKLUS LISO
Promotor PL dan PR terletak di kedua sisi yang berbeda dari gen cI, yang berhubungan dengan setiap promotor adalah operator (OL, OR).Dimana protein represor berikatan untuk mencegah RNA polymerase memulai transkripsi. Urutan masing-masing operator tumpang tindih (overlapping) dengan promotor yang mengontrol begitu sering digambarkan sebagai PL/OL dan PR/OR atau daerah kontrol.
Gen cI ditranskripsi dari promotor PRM
yang terletak diujung kanan
Represor adalah produk dari cI.
Represor → Mengikat operator ( OL dan OR ),
berinteraksi dengan operator sebagai dimer.
Represor mengikat sendiri untuk dua operator. Memiliki fungsi tunggal pada OL tapi memiliki fungsi ganda di OR.
Pada OL represor memiliki efek. Mencegah RNA polimerase memulai transkripsi di PL. Ekspresi ini berhenti mengekspresikan gen N. Sejak PL digunakan untuk semua transkripsi gen awal, tindakan ini mencegah ekspresi seluruh unit transkripsi awal ke kiri. Sehingga siklus litik terhalang untuk melanjutkan ke tahap awal.
Di OR, terdapat represor yang mengikat PR sehingga cro dan gen awal kanan lain tidak dapat terekspresi.