Notes

1) La proteolisi
La proteolisi è il processo di degradazione delle proteine da parte dell’organismo. Avviene in genere tramite idrolisi del legame peptidico ad opera di enzimi detti proteosomi. Spesso questi processi intervengono quando il ripiegamento della proteina non avviene in modo corretto o quando la proteina non serve più (degradazione fisiologica). La proteolisi lisosomiale ha un ruolo fondamentale nella cellula e rende ragione della maggior quota di proteine degradate ma è in genere poco specifica; esistono tuttavia altri processi proteolitici, caratterizzati da una maggior selettività:
a. Proteolisi ATP e ubiquitina dipendente (la proteina da rimuovere viene dapprima contrassegnata dal legame covalente con l’ubiquitina e successivamente, diventa il substrato di un sistema complesso endocellulare, denominata proteosoma formata da un numero elevato di subunità, che degrada la proteina riconosciuta in virtù dell’ubiquitina ad essa legata. Il pocesso di targeting è alquanto complesso e si svolge in più tappe:
• Avviene dapprima l’”attivazione” dell’ubiquitina con consumo di ATP, in questa prima tappa è implicato un enzima 1 (di attivazione dell’ubiquitina) che si lega all’ubiquitina tramite un legame tioestere. L’ATP viene scisso in AMP+pirofosfato e si ha quindi consumo di ATP.
• Un enzima 2, viene definito enzima di coniugazione dell’ubiquitina, porta al trasferimento dell’ubiquitina dall’enzima 1 all’enzima 2.
• Un terzo enzima, lo ubiquitina proteina ligasi, trasferisce la ubiquitina dall’E2 all’-ammino gruppo di qualche lisina sulla proteina che deve essere degradata.
b. Proteolisi calcio dipendente (si attivano con aumento del livello del calcio endocellulare).
c. Proteolisi dell’apoptosi (tramite Caspasi enzimi proteolitici endocellulari che svolgono un ruolo importante nel processo apoptotico.